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每年59月都有大量农田灌溉水泄入查干湖，为评价农田退水对查干湖水质造成的影响，以查干湖水质监测数据为基础，选用WASP模型的EUTRO模块，对农田退水退入查干湖后的水质情况进行分析。结果表明：农田退水期间，受霍林河来水影响的区域水质劣于查干湖水质平均水平，前郭灌区农田退水直接扰动区及新庙泡水质劣于主湖区、马营泡水质，说明农田退水已经对查干湖水质产生负面影响；预计2017-2019年，查干湖TN、TP、NH3-N、DO质量浓度分别符合V类、Ⅳ类、Ⅱ类和Ⅰ类水质标准。