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基于高分片段对的双序列比对分治算法SPDCA
基于高分片段对的双序列比对分治算法SPDCA
来源 :集美大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:CmMocean
【摘 要】
:
针对传统双序列比对算法的高时空复杂性,在动态规划比对算法的基础上,引入了片段对和分治思想,提出了一个新型的基于高分片段对的分治算法.模拟结果表明:该算法在降低了双序列比对
【作 者】
:
吕艳萍
陈水利
陈国龙
【机 构】
:
福州大学数学与计算机科学学院,集美大学理学院
【出 处】
:
集美大学学报:自然科学版
【发表日期】
:
2007年1期
【关键词】
:
生物詹息学
双序列比对
动态规划
高分片段对
分治
bioinformatics pairwise sequence alignment dynamic pr
【基金项目】
:
福建省自然科学基金资助项目(A0510023)
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针对传统双序列比对算法的高时空复杂性,在动态规划比对算法的基础上,引入了片段对和分治思想,提出了一个新型的基于高分片段对的分治算法.模拟结果表明:该算法在降低了双序列比对算法的时空需求的同时,还能发现双序列之间微弱的相似关系,可适用于序列数据库相似性的搜索.
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