为了筛选出适宜晋东南地区种植的最佳旱地番茄轮作作物，设置番茄轮作玉米（LVZm）、西葫芦（LVCp）、花生（LVAh）、葱（LVAf）、秋葵（LVAe）、黄瓜（LVCs）以及番茄连作（LLLe, CK）7种模式处理，测定后茬番茄品质指标（可溶性糖、有机酸、糖酸比、硝酸盐、Vc、可溶性蛋白、可溶性固形物、番茄红素）、产量指标（单果质量、产量）以及根际土壤真菌ITS1区域土壤微生物群落结构和多样性变化。结果表明，子囊菌是7个处理中的优势菌门，其余菌的种类与丰度存在较大差异；LVCs、LVZm、LVAh、LVAe这4种轮作模式可提高土壤真菌多样性指数，而LVCp轮作模式会降低土壤真菌多样性指数。LVZm轮作模式口感较佳；LVAe轮作模式、LLLe（CK）连作模式的Vc含量最高；可溶性蛋白含量没有显著差异；可溶性固形物含量以LLLe连作模式、LVCp轮作模式较高；LVCp轮作模式番茄红素含量最高；LVAe轮作模式硝酸盐含量最高。LVAe、LVCp轮作模式产量较LLLe（CK）显著提高，且LVCp轮作模式单果质量较LLLe（CK）显著增加。主成分分析（PCA）结果表明，不同作物轮作品质、产量综合得分从高到低为LVCp＞LVAe＞ LLLe＞ LVAh＞LVAf＞LVZm＞LVCs。综上所述，不同作物的轮作会改变土壤真菌群落结构，影响真菌多样性及后茬番茄品质与产量，综合各因素认为，西葫芦、秋葵是较为适宜晋东南地区番茄生长的优势轮作作物。