miR-497抑制结肠癌细胞HCT116炎症相关基因表达的基因芯片研究

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目的

采用基因芯片分析miR-497高表达对结肠癌细胞HCT116基因表达谱的影响。

方法

利用慢病毒感染人结肠癌细胞株HCT116,建立miR-497稳定高表达的结肠癌细胞模型HCT116-497细胞及阴性对照HCT116-CON细胞,用全基因组表达谱芯片筛选差异表达基因,利用MAS 3.0生物信息注释系统进行基因本体(gene ontology,GO)和信号通路富集分析(pathway analysis),筛选炎症相关基因。应用实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)对候选基因进行验证。

结果

筛选出绝对倍数变化(absolute fold change)3.0倍以上的下调基因582个,发现其主要富集于炎症相关细胞因子网络等信号通路。选取下调基因中参与细胞因子网络和MAPK信号通路的15个炎症相关基因进行PCR验证后显示,与HCT116-CON细胞相比,HCT116-497细胞中10个基因(CACNB1、FOS、IL-29、RPS6KA2、TNFSF15、IL-11、INHBC、CSF1R、JAK3和IL-2Rβ)表达水平降低,差异均有统计学意义(均P<0.05),与芯片结果一致。

结论

miR-497抑制结肠癌细胞HCT116中炎症相关基因mRNA的表达。

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