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以分离群体mRNA反转录的cDNA为模板进行AFLP分析,在保留AFLP多态性丰富、稳定性高、无需了解序列信息等优点的同时,集中显示基因组表达序列的多态性差异,已逐渐发展成为基因差异表达显示、表达基因遗传连锁作图和基因克隆的常用方法.本文介绍了作图群体组配、总RNA提取与mRNA分离、cDNA合成、AFLP分析、转录图谱多态性分析作图等cDNA-AFLP分析的主要技术.