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《温疫论》中体现杂气致病、邪伏募原、一药治一病等学术致思方向,既重视对具体、微观病因探求,又重视对传染性疾病共性研究;在治疗上既有针对共性特征的九传治法,又有"以物制气""一药治一病"的特效药物治疗思路。这种既重视共性特征,又把握个性特质的学术致思方向,对于继承发展中医学具有重要指导意义。