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目的
了解广州地区2008年5-6月份手口足病的病原。
方法设计肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型和肠道病毒属通用实时荧光RT-PCR引物和TaqMan探针，运用TaqMan实时荧光RT-PCR技术，对2008年5至6月，到广州市儿童医院就诊的疑似手足口病患儿咽拭子标本1023例(份)，同时分别进行肠道病毒属、肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型检测。对肠道病毒属荧光RT-PCR检测阳性，而肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型荧光RT-PCR检测阴性的标本进行5′非编码区(Untranslated Region UTR)的扩增和序列测定。
结果在1023份临床标本中，肠道病毒属阳性434例，检出率为42.42%。其中，肠道病毒71型276例，柯萨奇病毒A16型126例，肠道病毒84型4份，埃可病毒11型3例，埃可病毒9型2例，柯萨奇病毒B3型3例，柯萨奇病毒A10型4例，柯萨奇病毒A6型3例，柯萨奇病毒A12或A5型6例，另有7例难以区分型别，没有混合感染。
结论2008年5~6月广州地区手足口病的主要病原是肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型，并有肠道病毒84型、柯萨奇病毒A10型、柯萨奇病毒A12型、柯萨奇病毒A6型、柯萨奇病毒B3型、埃可病毒11型、埃可病毒9型等小部分其他型别肠道病毒感染。