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为进一步改进转基因棉花室内筛选系统，使用5000mg·L^-1浓度卡那霉素分别对转Bt基因棉花和非转基因棉花品种新陆早33的种子进行卡那霉素影响侧根生成的实验研究，经过卡那霉素溶液处理的棉花种子在基质中培养5d后进行数据统计，然后分别提取生成和不生成侧根的棉花幼苗子叶DNA，进一步经聚合酶链式反应（PCR）鉴定确认。结果表明：用5000mg·L’的卡那霉素对2个品种进行筛选时，Bt棉89％有侧根形成，而新陆早33仅2％有侧根发生。PCR鉴定结果也显示有侧根生成的棉花幼苗具有卡那霉素抗性