【摘 要】
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为了获得白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据库和差异表达基因,通过Illumina HiSeq4000高通量测序技术对白羊草对照组和干旱胁迫组进行转录组测序。经组装分析共获得1
【机 构】
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山西省农业科学院畜牧兽医研究所; 山西农业大学动物科技学院;
【基金项目】
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现代农业产业技术体系专项资金(CARS-35-25);物种品种种质资源保护项目“牧草种质资源更新繁殖、评价鉴定”(131721301354051034);山西省农业科学院博士基金“白羊草BiNAC编码基因的功能鉴定及分析”(YBSJJ1507);农业技术试验示范专项经费“山西省2016年国家草品种区域试验”(13162130106232053)
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为了获得白羊草(Bothriochloa ischaemum)转录组数据库和差异表达基因,通过Illumina HiSeq4000高通量测序技术对白羊草对照组和干旱胁迫组进行转录组测序。经组装分析共获得118580条Unigenes;将所得到的Unigenes与基因库数据进行比较,对Unigenes进行功能注释,共50070条Unigenes获得功能注释。白羊草转录组中的Unigenes根据GO功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程三大类共54个分支。通过将所有Unigenes与KOG数据库比对,共有1586条Unigenes可归为25类。以KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将Unigene定位到116个代谢途径分支。通过差异性分析发现,差异性表达基因共3987条,其中上调基因占39.45%,下调基因占60.55%。本研究为白羊草分子生物学研究提供了宝贵的基因组数据库资源。
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