【摘 要】
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作为人类基因组重要的表观遗传现象,DNA甲基化对基因的表达发挥着重要的调控作用,与癌症的关系密切。针对癌症基因组图谱(TCGA)庞大数据的类不平衡和高维度,致使假阴率大幅增
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.81602961)
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作为人类基因组重要的表观遗传现象,DNA甲基化对基因的表达发挥着重要的调控作用,与癌症的关系密切。针对癌症基因组图谱(TCGA)庞大数据的类不平衡和高维度,致使假阴率大幅增加的问题,提出了一种混合采样的不平衡数据集成分类算法,使用合成少数过采样(SMOTE)算法生成新的少数类样本,得到扩充后的数据集,通过Tomek Link算法剔除样本扩充过程中引入的噪声,得到相对平衡的数据集。在此基础上,利用深度森林(gcForest)算法的级联森林结构,每一层选取两种随机森林结构,以增强模型的泛化能力,得到最终的分类
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