三浅裂野牵牛MADS-box基因家族全基因组鉴定与组织特异性表达分析

来源 :激光生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：song198143

【摘要】

：

在甘薯近缘种三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)全基因组水平上对MADS-box基因家族进行鉴定和分析,结果表明,在三浅裂野牵牛基因组中,共鉴定到38个MADS-box(ItfMADS)成员。根据理化性质分析,各成员的氨基酸数目差异很大,有26个成员显碱性。亚细胞定位表明,在这些成员中有32个定位于细胞核。系统进化分析发现,ItfMADS家族可分为Ⅰ型和Ⅱ型2类,Ⅰ型包含9个成员,Ⅱ型包含29个成员。染色体定位分析发现,该38个ItfMADS成员不均匀地分布在三浅裂野牵牛基因组的12条染色体上,

【作者】

：

姚旭峰董静静刘世芳张毅唐锐敏王文斌解红娥吴宇浩武宗信贺立恒李润植贾小云

【机构】

：

山西农业大学生命科学学院,山西农业大学农学院,山西农业大学棉花研究所

【出处】

：

激光生物学报

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

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三浅裂野牵牛 MADS-BOX 基因组鉴定组织特异性表达分析

【基金项目】

：

国家重点研发专项项目(2018YFD1000705,2018YFD1000700),国家青年科学基金项目(31900450),山西省高等学校大学生创新创业训练计划项目(2020117),山西省新兴产业领军人才项目(2019061),山西省高等学校科技创新项目(2019L0388),山西省研究生教育创新项目(2020BY057),山西省农业科学院应用基础研究计划项目(YGC2019F24),2020

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