为了解西藏高原青稞种质材料的遗传多样性,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对西藏54份青稞农家种,野生近缘种材料进行了清蛋白和球蛋白遗传多样性分析。研究表明,参试材料共分离出迁移率不同的清蛋白谱带26种,其变幅在10~21条,其中6、9、21和24号谱带在参试材料中均有出现,出现频率为100%,是共有带;13号谱带出现频率最低,出现频率为25.93%;清蛋白有效等位基因数(ne)为1.0~1.99;多样性指数(H)为0~0.5;Shannon’s信息指数为0~0.69。球蛋白分离出迁移率不同的谱带类型31条,其变幅在12~26,出现的频率为15.63%~100%,其中9、12、13、28、29号谱带在参数材料中均有出现,其出现频率为100%,为共有带;23号谱带出现频率最低,为15.63%;球蛋白ne、H、Shannon’s与清蛋白数据相似。按海拔高度将54份青稞材料分海拔<3 000、3 000~3 500、3 500~4 000和>4 000 m海拔的4个地理类群,各类群基因多样性指数分别为0.20±0.22、0.29±0.21、0.31±0.19和0.34±0.72,Shannon信息指数分别为0.29±0.31、0.42±0.29、0.45±0.27和0.50±0.24,多态性带百分率依次为49.12%、71.93%、77.19%和84.21%。表明随着海拔高度增加,青稞蛋白的遗传变异逐渐提高。清蛋白和球蛋白谱带聚类分析显示,在相似系数为0.775水平上,可将参试材料分为8个类群,表明清蛋白和球蛋白能在一定程度上反映种质间的亲缘关系。本研究可为西藏青稞资源开发和优良亲本选配提供理论依据。