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为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒（ PRRSV）新分离株JL580遗传变异特征，研究扩增得到了该病毒的全基因组序列，并对GP 5和NSP 2序列进行了比对分析。结果表明：JL580株属于美洲株，且不同于中国现流行的其他毒株，与中国代表毒株 CH－1a 的核苷酸同源性是84．9％，与HP－PRRSV代表株JXA1、HuN4、TJ的核苷酸同源性分别是84．8％、84．9％、85％。对基因组的进一步分析表明，JL580株 GP5蛋白与 CH－1a、VR－2332、HuN4相比，R13→Q13，V27→A27，H38