【摘 要】
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在基因一药物多重网络中利用模块鉴别方法推断出新的基因一药物关联,可以为已知的药物确定新的治疗靶向基因.本文基于肿瘤药物敏感性基因组学(GDSC)数据库中肺癌的基因表达数据和药物响应数据,提出一种多重网络算法,首先构造出不同细胞系下肺癌基因与药物的异构网络,然后利用基于图熵的网络模块鉴别方法,在该异构网络中进行模块的鉴别,通过迭代收敛共鉴别出5个肺癌基因一药物关联模块.与其它方法对比,该算法在运行时间、准确性和鲁棒性方面均有更好的效果,且鉴别出的模块具有明显的生物学意义.本文的研究结果对于肺癌的用药治疗具有
【机 构】
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江南大学理学院 江苏无锡214122
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在基因一药物多重网络中利用模块鉴别方法推断出新的基因一药物关联,可以为已知的药物确定新的治疗靶向基因.本文基于肿瘤药物敏感性基因组学(GDSC)数据库中肺癌的基因表达数据和药物响应数据,提出一种多重网络算法,首先构造出不同细胞系下肺癌基因与药物的异构网络,然后利用基于图熵的网络模块鉴别方法,在该异构网络中进行模块的鉴别,通过迭代收敛共鉴别出5个肺癌基因一药物关联模块.与其它方法对比,该算法在运行时间、准确性和鲁棒性方面均有更好的效果,且鉴别出的模块具有明显的生物学意义.本文的研究结果对于肺癌的用药治疗具有指导意义,并且可以为其它具有相同靶向基因的疾病治疗提供参考.
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