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目前高通量测序是指一次性对上百万乃至上亿条DNA分子进行的并行测序技术。高通量测序使人类能够以短时间、低成本的方式从基因组学角度对各种生命现象做出精细描绘,同时该技术也为后基因组时代,即蛋白质组学的深入研究提供了准确蓝本。本文就高通量测序在病原微生物领域的应用进展进行总结。从病原微生物分类、传染病监测、病原微生物耐药以及人类微生物组分析这四方面进行综述。