芝麻EST-SSR标记的开发和初步研究

来源 :作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：xiaolongyang

【摘要】

：

为加速分子标记在芝麻研究中的应用，利用网上现有的芝麻EST（expressed sequence tags）数据信息，开展了芝麻EST-SSR功能性标记的开发和利用研究。在所有的3328条芝麻EST序列中共确

【作者】

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魏利斌张海洋郑永战郭旺珍张天真

【机构】

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南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,河南省农作物新品种重点实验室

【出处】

：

作物学报

【发表日期】

：

2008年12期

【关键词】

：

芝麻表达序列标签(EST) 简单重复序列(SSR) 多态信息含量(PIC) 遗传多样性 Sesame （Sesamum indicum L.） EST S

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为加速分子标记在芝麻研究中的应用，利用网上现有的芝麻EST（expressed sequence tags）数据信息，开展了芝麻EST-SSR功能性标记的开发和利用研究。在所有的3328条芝麻EST序列中共确认得到1785条非冗余EST序列。其中，在含有微卫星重复的148条序列中共检测有155个EST-SSR。非冗余EST序列总长为774．27kb，平均每4．99kb含有一个EST-SSR。EST-SSR的分布频率和特征分析表明，以AG/TC为重复基元（motif）的SSR出现最多，占总SSR的37．42

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