植物EST-SSR标记开发及其应用

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：my85643284

【摘要】

：

随着生物科技的进步,大量的植物表达序列标签（expressed sequence tags,ESTs）已经成为开发SSR标记的重要资源。EST-SSR作为一种新型分子标记,其多态性可能与基因功能直接相关,

【作者】

：

张利达唐克轩

【机构】

：

上海交通大学农业与生物学院植物生物技术研发中心

【出处】

：

基因组学与应用生物学

【发表日期】

：

2010年3期

【关键词】

：

表达序列标签(ESTs) 简单重复序列(SSRs) EST-SSRs

【基金项目】

：

上海市科委基础重大项目(09DJ1400504);上海交通大学晨星青年学者奖励计划(0809)共同资助

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随着生物科技的进步,大量的植物表达序列标签（expressed sequence tags,ESTs）已经成为开发SSR标记的重要资源。EST-SSR作为一种新型分子标记,其多态性可能与基因功能直接相关,而且在相近植物间具有良好通用性,使得EST-SSR标记在实际应用中更具价值。采用计算机方法大规模发掘EST-SSR多态性位点极大地提高了SSR标记开发效率。尤其随着新一代测序技术的成熟以及测序成本的急剧下降,利用新一代测序技术产生大量的转录组数据进行EST-SSR多态性标记的计算机大规模发掘将对SSR标记

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