寻找水稻DNA编码与非编码区边界方法的比较研究

来源 :遗传 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wain155

【摘要】

：

在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具.为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提

【作者】

：

孙奕钢高雷张忠华薛庆中

【机构】

：

浙江大学理学院数学系,中国科学院理论物理研究所,浙江大学沃森基因组科学研究院,浙江大学沃森基因组科学研究院

【出处】

：

遗传

【发表日期】

：

2005年4期

【关键词】

：

Jensen-Shannon离散量 Jensen-Renyi离散量 α-KL离散量 α-Jensen-Shannon离散量 GO含量编码与非编码区水稻 J

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

在分析DNA序列复杂度、预测基因编码区和非编码的DNA边界识别等问题中,以熵为基础构造的离散量度量提供了一种强有力的工具.为改进寻找水稻基因编码与非编码区边界的效率,提出了两个新的离散量度量(α-kL离散量与α-Jensen-Shannon离散量),根据密码子的GC含量对氨基酸对应密码子构建了粗粒化向量.比较了融合Jensen-Shannon离散量、Jensen-Renyi离散量、α-KL离散量和α-Jensen-Shannon离散量等不同向量所获得的精度,结果表明,在对水稻基因编码区‘终止子'的

其他文献

壳聚糖作为基因药物载体的研究进展

以壳聚糖及其衍生物作为基因的载体的转染效率受到许多因素的影响，如复合物粒子大小、壳聚糖，DNA的比值、壳聚糖的分子量、脱乙酰度、转染过程中血清的浓度、介质的pH值等。对

期刊

壳聚糖转染基因载体机制chitosan transfection non-viral gene delivery mechanism

破骨细胞形成抑制因子TNFR结构区在大肠杆菌中表达、抗体制备及活性测定

破骨细胞形成抑制因子(OPG)对骨的重建与再吸收有重要调节作用,其TNFR结构区行使抑制破骨细胞形成与活性的功能.通过PCR将该区基因片段克隆出来,插入表达载体PET-28a质粒多克

期刊

破骨细胞形成抑制因TNFR结构区大肠杆菌抗体降血钙活性osteoprotegerin TNFR domain E. coli antibody h

人类群体遗传空间结构对应分析中的“蹄型效应”及其遗传学解释

探讨了人类群体遗传结构对应分析中"蹄型效应"的产生机制及其遗传学解释.从分析基因频率矩阵的结构特点入手,以实例验证和比较了对应分析中散点图的结构特征.发现当基因频率

期刊

人类群体遗传结构对应分析蹄型效应human population genetic structurecorrespondence analysis＂h

中国南方汉族人群6个Y-STR基因座遗传多态性及法医学应用

为研究中国南方汉族人群DYS393等6个Y-STR基因座的遗传多态性并用于法医学鉴定,通过采用PCR复合扩增和基因测序仪荧光检测方法,检查204个无关男性个体,调查南方汉族的6个Y-ST

期刊

Y染色体短串联重复序列(STR)单倍型遗传多态性Y-chromosomeshort tandem repeat (STR)haplotypegen

不同地区库蚊复组群体的同工酶遗传多样性研究

采用水平切片淀粉凝胶电泳的方法,对分布于我国5省的8个库蚊复组(Culex pipiens complex)野生群体的遗传多样性进行研究,分析了4个酶系统7个基因座(ME、MDH-1、MDH-2、MDH-3

期刊

库蚊复组群体同工酶遗传多样性遗传分化同工酶淀粉凝胶电泳Culex pipiens complex genetic diversity isoen

隐光敏素及其信号传导研究进展

隐光敏素是一种对植物生长发育起调节作用的与光敏素功能相似的蓝光受体。90’s后特别是近年来对植物隐光敏素进行了较深入的研究,已知隐光敏素存在于植物,也存在于动物中。隐光敏素在植物种子萌发中的去黄化作用、光周期诱导开花、调节昼夜节律性等方面起重要作用;本文介绍了隐光敏素基因及其蛋白质的特征特性,包括隐光敏素的结构特征,在植物中的分布、在细胞中定位及其基因表达情况; 在其基础上,概述了隐光敏素调节植物

期刊

隐光敏素信号传导功能cryptochromesignal transductionfunction

浙江地区青霉素耐药肺炎链球菌PBPs基因及氨基酸序列研究

为阐明浙江地区青霉素耐药肺炎链球菌(PRSP)的青霉素结合蛋白(PBPs)的基因和氨基酸序列的变异特点,对温州医学院自2000年11月～2004年1月收集的26份肺炎链球菌进行分离、鉴定及

期刊

肺炎链球菌(SP)青霉素耐药的肺炎链球菌(PRSP)青霉素结合蛋白(PBPs)Streptococcus pneumonia （SP） penicil

中国维吾尔族人群MSY1（DYF155S1）基因座多态性及其结构特点

应用荧光标记MVR-PCR、Amp-FLP与DNA序列分析技术等检测106例中国维吾尔族人群无关男性个体血纱样品，揭示了中国维吾尔族人群Y特异的小卫星MSY1(DYF155S1)基因座5′和3′端多

期刊

中国维吾尔族人群MSY1(DYF155S1)基因座多态性结构特点DYF155S1 MVR-PCR minisatellite DNA Y ch

内蒙古蒙古族人群DYS413基因座的多态性分布

为调查DYS413(YCAⅢ)基因座在内蒙古蒙古族人群中的分布情况,为其应用于法医学和人类遗传学研究提供依据,采集了120例内蒙古蒙古族男性无关个体静脉血,EDTA抗凝,用酚-氯仿法

期刊

DYS413(YCAⅢ)基因座STR单倍型法医学人类遗传学DYS413(YCA Ⅲ)locusSTRhaplotypeForensic

ZNF230/荧光蛋白融合基因表达载体的构建及其在Cos细胞中的表达与定位

为了用绿色荧光蛋白标记观察人类无精症相关基因ZNF230在Cos7细胞中的蛋白质表达及定位，用PCR方法扩增得到突变的人和小鼠mt-ZNF230和mt-znf230基因，使其3’端的终止密码TGA突

期刊

znf230基因绿色荧光蛋白基因表达定位COS细胞ZNF230 genegreen fluorescent proteinlocalization

寻找水稻DNA编码与非编码区边界方法的比较研究

与本文相关的学术论文