【摘 要】
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硬骨鱼类具有独特的免疫系统,其头肾和体肾是重要的造血和免疫器官.为探索黄颡鱼头肾和体肾造血和免疫功能异同,采用Illumina HiSeq NovaSeq 6000测序平台对黄颡鱼头肾和体肾进行了转录组高通量测序;测序序列经质控、组装后,共获得59979个转录本(transcript),N50为3919 bp;获得的转录本在NR、GO、KEGG、Swiss-Prot和Pfam数据库中比对和注释,共有24487个Unigenes获注释.差异表达基因分析显示,1112个基因在头肾中上调,包括KIT配体、早期B
【机 构】
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浙江海洋大学水产学院 舟山 316022
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硬骨鱼类具有独特的免疫系统,其头肾和体肾是重要的造血和免疫器官.为探索黄颡鱼头肾和体肾造血和免疫功能异同,采用Illumina HiSeq NovaSeq 6000测序平台对黄颡鱼头肾和体肾进行了转录组高通量测序;测序序列经质控、组装后,共获得59979个转录本(transcript),N50为3919 bp;获得的转录本在NR、GO、KEGG、Swiss-Prot和Pfam数据库中比对和注释,共有24487个Unigenes获注释.差异表达基因分析显示,1112个基因在头肾中上调,包括KIT配体、早期B细胞因子1、Toll样受体1和2等免疫相关基因;2737个基因在体肾中上调,如C-C趋化因子19和25、补体5和9、白细胞介素17受体C、RIG-Ⅰ和白细胞介素27等免疫相关基因,部分抗体重链可变区编码基因和抗体轻链κ链可变区编码基因仅在体肾中表达.结果 表明,黄颡鱼头肾和体肾中免疫相关基因表达具有差异性,两者造血和免疫功能具有组织特异性.研究结果有助于黄颡鱼头肾和体肾造血和免疫功能研究,可为黄颡鱼病害防治提供基础资料.
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