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蛋白质的二级结构可以分为两类: 规则二级结构和非规则二级结构.α螺旋和β折叠是典型的规则二级结构, 它们的残基具有重复的主链转角, 而且它们的N-H和C-O基团以氢键形式周期分布. 相比之下, 剩余的部分没有可重复转角, 称之为非规则二级结构. 对蛋白质氨基酸序列做了广泛的分析, 结果表明, 用连续小波变换可以对蛋白质氨基酸序列中的非规则二级结构进行有效的预测.