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木瓜属是我国传统观赏花木和中药材,目前已发表的5个原种中4种原产中国,我国拥有绝对的资源优势,因此,利用我国木瓜海棠巨大的资源优势,进行种质资源创新,对丰富木瓜海棠新品种和园林应用前景具有重要意义。对上海植物园杂交选育的20个优良单株进行形态学性状和AFLP标记2个层面的分类和遗传鉴别。结果表明:从64对引物组合中筛选出9对引物组合效果较好,共扩增出1367条清晰条带,其中共有位点40个,多态性位点1327个,多态性97.07%。9对引物能够很好地区分不同的杂交后代,但采用AFLP标记对杂交后代进行分类的