目的 分析厚朴鲜树皮直接“发汗”的前中后3个时期的微生物群落结构及特征。方法 将厚朴鲜皮直接堆放“发汗”后，分别取“发汗”第0、3、6 d的样品进行高通量测序，运用美吉生信云分析平台（https://cloud.majorbio.com）进行微生物群落结构及特征分析。结果 “发汗”前中后3个时期共检测到6个真菌菌门，子囊菌门Ascomycota在“发汗”整个过程中处于绝对优势地位。担子菌门Basidiomycota、未分类的真菌门Unclassified＿k＿Fungi和接合菌门Zygomycota在“发汗”中丰度明显升高。壶菌门Chytridiomycota和隐真菌门Rozellomycota仅在“发汗”中出现，且丰度极小。共检测到10个门水平细菌，变形菌门Proteobacteria在整过“发汗”过程中处于绝对优势地位且在中后期丰度进一步提高。浮霉菌门Planctomycetes、酸杆菌门Acidobacteria、装甲菌门Armatimonadetes及Saccharibacteria门在“发汗”中后期消失，且整过“发汗”过程中无新增优势菌门出现。结论 真菌物种丰度和多样性在整个“发汗”过程中均为先上升后下降，且“发汗”后真菌物种丰度和多样性在整个“发汗”过程中最低。除变形菌门Proteobacteria在中后期丰度有所增加外，细菌物种丰度和多样性在整个“发汗”过程中均呈下降趋势，甚至部分菌门接近消失。实验结果支持真菌在“发汗”过程中发挥作用，对进一步寻找厚朴“发汗”过程中发挥作用的菌属具有一定参考价值。