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祁连山自然保护区地处甘肃、青海两省交界处，东起乌鞘岭的松山，西到当金山口，北临河西走廊，南靠柴达木盆地。祁连山是由一系列平行排列的山岭和谷地组成，一般海拔3000～5000米，主峰海拔5547米。爱受高原寒冷气候的影响，祁连山在海拔4200米以上的高山地带，终年积雪，形成的冰川达2859条，总面积1972．5平方千米。冰雪融化成为羊河、黑河、疏勒河三大水系、56条内陆河流的源头。年径流量72．6亿立方米，