蛋白质在格子模型中改进的PERM算法

来源 :计算机科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tq08eb0
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
PERM算法是当前蛋白质结构预测的格子模型优化算法中最为有效的一种算法,在该算法的基础上,我们提出了一种改进的增长算法IPERM。该方法简化了PERM算法中的权重计算公式,在遇到不同类型的残基时选用不同的上下限阂值以提高算法的有效性,并根据链长的大小使用不同的网格尺寸。实验结果表明,改进的增长算法使得HP序列在格子模型中能更快地找到其能量最低构象。
其他文献
激励机制是P2P(对等网)中的一个重要的研究课题。P2P这种新的成功模式需要建立一个应用已有成熟的技术的激励机制来实现。本文提出了一种在P2P环境申基于拍卖的激励机制。在P2P
DNA微阵列技术使同时监测成千上万的基因表达水平成为可能.直接把传统聚类算法用于高维基因表达数据分析会受到"维难"的困扰.特征转换和特征选择是两种常用的降维方式,但前者产
针对标准人工免疫算法存在的早熟收敛和后期收敛速度慢的问题,本文提出了一种基于小生境技术和聚类分析的改进的人工免疫算法。首先运用嵌入进化标记的小生境技术对初始种群进
选播是定义在IPv6中的一种新型的网络服务。它可以实现一台主机与一组目的主机之间最“近”的一个通信。本文提出了一种负载均衡选播路由算法,并利用改进的遗传算法求最优解。
传感器网络技术的发展导致了在应用与网络之间建立中间件,根据系统资源及网络能源保证在网络上并发运行的应用的QoS。首先,本文结合传感器网络的特性及实时应用的特点,定义了一
先天性生殖器官发育异常合并无性细胞瘤及浆液性囊腺瘤为罕见的一种先天畸型,作者在2003年病检工作中发现1例,现报告如下.