【摘 要】
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目的 了解云南省目前HIV-1流行株的基因型及其地区和人群分布.方法 收集2008-2009年云南省15个地市788例HIV感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)的血浆标本和背景信息,采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因(1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp),序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03软件工具确定病毒基因型,分
【机 构】
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650301昆明,云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心HIV实验室,650301昆明,云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心HIV实验室,军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,军
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目的 了解云南省目前HIV-1流行株的基因型及其地区和人群分布.方法 收集2008-2009年云南省15个地市788例HIV感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)的血浆标本和背景信息,采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因(1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp),序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03软件工具确定病毒基因型,分析HIV-1株的地区和人群分布特征.结果 788例标本获得1728条HIV-1基因序列,其中全长gag基因序列599条、全长pol基因序列564条、env基因C2V3区序列525条,确定617例基因亚型,构成比分别为CRF08 BC(50.2％)、CRF01 AE(25.0％)、未知重组(10.2％)、CRF07_BC(9.2％)、C亚型(2.9％)和B(B')亚型(2.4％).HIV-1株在云南省具有地域分布特征,可分为以临沧和昆明为代表的CRF08_BC为主的地区,以德宏和西双版纳为代表的CRF08 _BC与CRF01 _AE构成比相近的地区；未知重组型在云南省少数民族中所占比例(17.0％)显著高于汉族(6.7％)；异性性传播感染者和静脉注射吸毒感染者的CRF08 BC亚型均占总数的50.0％以上,但前者CRF01_AE的构成比占约30.0％,后者未知重组型和CRF07 BC的比例分别达到约15.0％.未知重组病毒株呈现两种重组模式,分别为B(B')/C重组和以CRF01 AE为母株嵌入B(B ')和/或C片段重组,并以前者为主(74.6％).结论 云南省HIV-1株组成复杂,具有显著的地域、民族和传播途径相关的特征,并出现新型重组病毒株,应密切监测。
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