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西瓜苗期、成株期均可发病。轻者症状一般不明显，主要是叶片发黄，生长势弱，中午天热时叶片因根系吸水受阻而萎蔫，茎蔓细。重者植株明显矮化，化瓜严重或瓜秧过早死亡。拔起病株，根部有许多大小不等、形状不一念珠瘤状物，更甚者，整个根系变成凹凸不平的肉质根。根瘤形成初期为白色，质地柔软，后变褐色，表面具有不规则裂口。