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提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA.采用公共多序列比对数据库BAliBASE中142组蛋白质序列作为比对测试数据,并与ClustalW进行比较.比对结果的统计分析表明,IPMSA算法的比对准确率高于ClustalW.
基于迭代渐进多序列比对算法研究
【摘 要】
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提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA.采用公共多序列比对数据库BAliBASE中142组蛋白质序列作为比对测试数据,并与ClustalW进行比较.比对结果的统计分析表明,IPMSA算法
【机 构】
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大连理工大学计算机系,中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所,大连理工大学计算机系
【出 处】
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计算机工程
【发表日期】
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2005年17期
【基金项目】
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国家自然科学基金
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