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利用中国粳稻种质滇粳优2号（B90）和日本粳稻冷香粳（X1）筛选100条ISSR引物。利用筛选出的10条引物对来自中国、日本等国家的40份特异粳稻进行遗传多样性分析。PCR扩增结果表明，10条ISSR引物在40份材料中共扩增出2600条DNA带，其中多态性位点有42个．平均每条引物可以检测到4．2个多态性位点。聚类结果表明，各供试材料聚为3大类，遗传相似性系数范围为0．62～1．00。相同居群的中国特异粳稻种质基本能聚为一类，但是与部分日本粳稻交叉聚在一起。这表明：粳稻种质的遗传差异与气候变化类型的相关性