【摘 要】
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目的 运用基因芯片数据分析软件对口腔黏膜下纤维化(oral submucosa fibrosis,OSF)差异表达基因进行分析,研究其隐含的生物学意义.方法 利用DAVID和Onto-express两种基因芯片
【机 构】
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中南大学湘雅医院口腔颌面外科,中南大学湘雅医院口腔内科
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目的 运用基因芯片数据分析软件对口腔黏膜下纤维化(oral submucosa fibrosis,OSF)差异表达基因进行分析,研究其隐含的生物学意义.方法 利用DAVID和Onto-express两种基因芯片数据分析软件对前期筛选的865个OSF差异表达基因进行染色体定位、GO分析(gene ontology)和遗传关联疾病分析.结果 差异表达基因主要定位于1、2、5、6、7、11和12号染色体上(P＜0.01);GO分析显示差异表达基因主要参与免疫反应、防御反应等生物过程,并主要与细胞外基质、细胞骨架、细胞膜的组成和蛋白结合,细胞外基质结构组成和信号转导激活等分子功能相关;而与这些基因有遗传关联的疾病主要有感染,免疫和心血管疾病等.结论 运用基因芯片数据分析软件可快速分析大量的基因芯片数据,实现对差异基因初步的功能归类,为OSF的发病机制和流行病学研究提供新的思路.
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