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质核互作雄性不育在杂种优势利用中起着重要作用，探讨质核互作雄性不育发生的机理具有重要的理论和实践意义。本研究开展大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的不同器官蛋白质组比较分析。以大豆质核互作雄性不育系NJCMS1A和其保持系NJCMS1B的种子、叶片和花药为材料，采用双向凝胶电泳技术对其蛋白质进行分离，考马斯亮蓝染色，获得重复性好的蛋白质双向电泳图谱，利用PDQuest软件处理分析，寻找差异表达蛋白。结果发现不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的种子2-DE图谱间存在7个差