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本项目以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用测序技术筛查PPARγ、C/EBPα、ADD1基因多态性,并作相关生物信息学分析;以3、4、5、6、7月龄的江口萝卜猪、从江香猪和大白猪为试验材料,提取心、肝、脾、肺、肾、小肠、背最长肌和皮下脂肪的总RNA,应用实时荧光定量PCR技术检测PPARγ、C/EBPα、ADD1基因在3个品种不同月龄各组织中mRNA的相对表达量,并结合屠宰试验进行PPARγ、C/EBPα、ADD1基因表达水平与其肉质性能的相关性分析。获得主要结果如下:1.本研究对江口萝卜猪PPARγ、C/EBPα、ADD1基因进行多态位点检测。PPARγ基因共筛查出8个多态位点,其中位于外显子上有3个,其余5个均位于内含子上;ADD1基因共筛查出3个多态位点,其中位于外显子上有1个,2个位于内含子上;C/EBPα基因未检测出多态位点。位于PPARγ基因3个外显子中,exon2-C50T、exon7-G53T、exon9-C32T均为错义突变,对应的氨基酸由苏氨酸(Thr)改变为异亮氨酸(Ile)、天冬氨酸(Asp)改变为酪氨酸(Tyr)、丙氨酸(Ala)改变为天冬氨酸(Asp);位于ADD1基因外显子上的exon8-G87A位点为同义突变,其突变未引起氨基酸的改变。对引起错义突变的多态位点进行生物信息学分析表明突变前后mRNA二级结构、蛋白质二级、三级结构均有差异。2.PPARγ、C/EBPα、ADD1在大白猪3、4、5、6、7月龄各组织中均有表达,在肝、小肠、背最长肌、皮下脂肪的表达水平较高,心、脾、肺、肾的表达水平较低。其中PPARγ在小肠、背最长肌、皮下脂肪中3、4月龄分别与6、7月龄的表达量差异极显著(P<0.01)。C/EBPα、ADD1在肝、肺、小肠、皮下脂肪中3月龄与6、7月龄差异极显著(P<0.01);PPARγ、C/EBPα、ADD1在江口萝卜猪心、脾、肺、肾、背最长肌的表达量最低,在皮下脂肪中最高,具有组织特异性。其表达量随月龄递增而上升,皮下脂肪的增加幅度最大。其中PPARγ、ADD1在小肠、背最长肌、皮下脂肪中3、4月龄与6、7月龄的表达量差异极显著(P<0.01)。C/EBPα在小肠、皮下脂肪中3月龄与5、6、7月龄的表达量均差异极显著(P<0.01);PPARγ、C/EBPα、ADD1在从江香猪心、肝、脾、肺、肾、小肠、背最长肌的表达量较低,在皮下脂肪的表达量最高,PPARγ的表达量随月龄增加而上升的幅度较小,C/EBPα、ADD1在各组织中的表达量随时间增加而上升。其在小肠、皮下脂肪、背最长肌中3、4月龄与6、7月龄的表达量差异极显著(P<0.01)。总体上PPARγ、C/EBPα、ADD1基因在各组织均有表达,组织间的表达量存在差异,皮下脂肪的表达量最高,其次肝、肺、小肠、背最长肌中较高,心、脾、肾中的表达量最低,其中在肝、小肠、皮下脂肪中为高丰度表达。随着月龄的增加,PPARγ、C/EBPα、ADD1基因mRNA的表达模式基本相同,总体呈现上升趋势,6、7月龄的表达水平较高,即随着月龄的增加而逐渐上升,到生长后期维持一个相对稳定水平。不同品种间PPARγ、C/EBPα、ADD1在相同月龄各组织中的表达量存在差异,总体上大白猪肝、小肠、皮下脂肪中PPARγ、C/EBPα、ADD1 mRNA的表达量分别与江口萝卜猪、从江香猪差异显著(P<0.05)。综合而言,PPARγ、C/EBPα、ADD1基因在脂肪型江口萝卜猪、从江香猪的表达量高于瘦肉型大白猪。3.从江香猪、江口萝卜猪、大白猪肌肉的大理石纹、pH值、剪切力、肌内脂肪含量、粗蛋白含量随着月龄的增加而升高,失水率、滴水损失、水份含量、蒸煮损失随着月龄的增加而下降。从江香猪、江口萝卜猪其肉质性能测定均在正常范围之内,大白猪中其大理石纹评分、肉色评分、肌内脂肪含量在3、4月龄时较低,之后随着月龄增加而上升到正常值。总体上从江香猪、江口萝卜猪的肌内脂肪含量比大白猪高,6、7月龄时为4%以上。PPARγ、C/EBPα、ADD1基因在从江香猪、江口萝卜猪、大白猪的表达量与肉质性能均为正相关。在心、脾、肺、肾的表达量与肉色、pH值、滴水损失、大理石纹、失水率、蒸煮损失、剪切力、水份含量、粗蛋白含量、肌内脂肪含量相关性较小,在肝、小肠、背最长肌、皮下脂肪的表达量与大理石纹、剪切力、肌内脂肪含量、粗蛋白含量有较高相关性。