棉花纤维作为天然纺织原料在国民生产中举足轻重。棉花优质高产一直是育种家的重要目标。棉纤维是由胚珠外珠被表皮单细胞经突起并极性伸长形成的,有长绒（lint）和短绒（fuzz）之分。因此,克隆棉纤维光籽基因,研究其功能,为阐明棉纤维形成机制奠定了基础。棉花光籽基因n₂为陆地棉光籽突变体,是棉纤维研究的一个重要的种质资源。本实验以海岛棉野生型有短绒长绒棉材料新海21号和陆地棉光籽突变体n₂为亲本构建F₂群体,结合棉花基因组数据,开发SSR标记,对群体进行性状调查和遗传分析,完成光籽基因n₂的初步定位和精细定位,以此对候选区间进行基因预测、克隆和序列分析,研究结果如下:（1）以海岛棉野生型有短绒长绒棉材料新海21号和陆地棉光籽突变体n₂为亲本构建2个F₂分离群体,群体总大小为3997个单株。性状调查显示F₂群体有两种表型:有短绒和无短绒（光籽）,卡方检验显示性状分离比符合3:1的孟德尔遗传分离规律(χ²=0.59<χ²_0.05=3.84)。（2）在n₂基因定位在A12上标记NAU943和BNL1679间的6 cM区间内的基础上,结合棉花基因组数据,我们又开发了新的SSR标记,并从中筛选出10对多态性标记,用于目的基因的精细定位。最终将目的基因定位在标记P61和Z10之间,物理距离约181 kb。（3）对定位区间中候选基因分析发现,该区间共有7个预测基因。荧光定量结果显示,仅有一个候选基因在两亲本中的表达量有显著差异,这说明在棉花胚珠中,其表达量可能为造成性状差异的原因。为了方便后期对该基因进行功能验证,我们构建了该基因的病毒诱导基因沉默（VIGS）载体。