第一代公司代理问题研究的是在分散的股权结构下股权与债权之前冲突带来的代理成本,第二代代理问题则研究在股权结构出现高度集中时,现金流权与控制权分离产生的代理成本。自La Porta以来,学者开始重视这种分离引发的大小股东利益冲突。在中国,随着民营经济在资本市场上地位越来越重要,其高度集中的股权结构和伴随而来的代理成本也引发了国内外学者的兴趣。本文以沪深两市的家族上市公司作为研究的基本数据,并筛选出其中规模、经营效益符合本文研究要求的公司,将数据样本分为直接上市和间接上市两类,参考之前学者对终极控制权、现金流权的衡量方法,使用了描述性统计和实证检验形结合的方式,比较分析了不同上市方式的家族企业在终极控制权、现金流权分离上的差异性和这种差异性对公司价值产生的影响。主要的研究结论有四个：第一,家族企业中,直接上市公司的两权分离程度要低于间接上市公司；第二,无论上市方式如何,两权分离对公司的价值会产生负向影响,但是直接上市公司对该因素的敏感程度要弱于间接上市公司；第三,托宾Q比ROE更合适衡量公司价值；第四,独立董事制度与公司价值显著正相关,引入独立董事制度是目前能够保证公司经营策略有效合理的重要方式。本文该结论将有助于金融监管机构对上市公司进行有目标有重点地监管,尤其是加强对于间接上市公司的盈余管理监管,督促其降低两权分离程度,提高信息披露的质量和速度。同时,也有利于投资者在进行投资决策时,选择更适合自身的目标公司,并提升对自身股东权益的保护意识。