生态补偿机制中包含了自然保护区生态保护机制,成为生态文明同可持续发展战略中的重要保障之一,是自然保护区与受益地区平衡生态保护与经济发展的有效手段,已成为生态文明建设不可或缺的一部分。近几年来,各个自然生态领域根据己身服务供给情况,快速推进生态补偿机制研究。但由于重点生态区,尤其湿地生态补偿探索还在初期试点阶段,对其生态补偿相关研究相对较少。自然保护区具有保护生态原真性完整性的目的和土地权属的特殊问题,也使得自然保护区生态补偿机制与其他保护地研究有所区别。目前各自然保护试点地区也具有针对性地进行生态补偿相关机制探索实践,部分地区已取得了一定的成效,然广泛积极开展实践的同时必然会遭逢困难和问题。建立和完善自然保护区生态保护补偿机制是目前我国自然保护区建设的重点任务之一。因此,本研究着眼我国自然保护区生态补偿机制研究,通过系统梳理国内外关于自然保护区生态保护补偿机制研究的基础上,结合自然保护区生态保护补偿相关的理论基础与国外经验,以大山包黑颈鹤湿地自然保护区（后简称大山包）体制试点为实例,调查分析了大山包自然保护区生态补偿现状和取得的成效。并通过文件分析和专家访谈,总结大山包自然保护区生态补偿存在的问题,提出了大山包自然保护区生态补偿的内容设计,搭建了补偿主体、标准、方式和资金来源的框架,并利用演化博弈对大山包自然各主体利益诉求进行了量化和仿真分析,以便更好地寻找其原因与对策。最后根据对大山包自然保护区相关的研究,提出了自然保护区生态补偿的基本原理,构建自然保护区生态补偿框架。最后对自然保护区生态补偿的保障体系进行了探讨,希望对于完善中国自然保护区生态补偿理论体系和推进中国自然保护区生态保护补偿机制建设有所助益。