翡翠贻贝胚胎应答典型POPs的抗氧化和非特异性免疫酶效应及转录组学研究

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苯并芘(Benzo(a)pyrene,BaP)和滴滴涕(Dichlorodiphenyltrichloroethane,DDT)属于典型持久性有机污染物(POPs),同时也均属于环境雌激素(environmental estrogens,EEs);具有明显的"三致"效应,已引起环境科学家的广泛关注。翡翠贻贝主营滤食性固着生活,广泛分布于南海,另外,胚胎是其早期发育的重要阶段,也是一个非常敏感脆弱的时期。而目前,有关典型POPs对翡翠贻贝胚胎的毒性机制尚不清楚。因此,本论文以苯并芘和滴滴涕为污染物,以热带优势贝类(翡翠贻贝)(Perna viridis)胚胎为研究素材;利用转录组学技术,同时结合酶学方法探究其对翡翠贻贝胚胎的毒理效应,为揭示其胚胎的毒理机制打下一定的基础,同时为早期预警监测及风险评价提供一定的科学数据。主要研究结果如下:1.翡翠贻贝胚胎应答典型BaP和DDT胁迫的抗氧化及非特异性免疫效应BaP和DDT胁迫显著影响翡翠贻贝胚胎抗氧化酶(SOD、GPx)和非特异性免疫酶(ACP、AKP)的活性。与对照组相比,随曝毒浓度升高其胚胎内SOD、AKP的活性呈现先抑制后诱导的趋势,对GPx具有明显的诱导作用。DDT和BaP对ACP酶活性的影响不同,其中BaP对ACP活性呈现先抑制,后恢复,这可能是由于翡翠贻贝胚胎对BaP胁迫具有一套自身适应机制。而DDT对翡翠贻贝胚胎ACP的活性影响不显著。进一步,利用整合生物标志物指数法对苯并芘和滴滴涕胁迫翡翠贻贝胚胎的毒性效应进行定量化评价。结果表明:胁迫早期,随着浓度升高RIB值逐渐增大,随着染毒时间延长,处理组RIB值均减小,总体来说,DDT的RIB值比BaP的RIB值大,表明DDT的胚胎毒性较强。2.BaP和DDT对翡翠贻贝胚胎的转录组深度测序分析应用Illumina高通量测序技术,用不同浓度的BaP和DDT暴露处理后对翡翠贻贝胚胎进行转录组深度测序,获得了 93,362,846条raw reads,92,362,742条clean reads,GC含量达到35%以上,Q20达到98.12%,根据这些指标可判定数据质量完全能满足后续生物信息分析要求。通过基因差异表达分析、GO功能显著性富集分析和KEGG显著性分析等,结果显示COG数据库中贻贝胚胎中与细胞生长分裂的、胚胎发育的基因占主体地位。GO功能注释后贻贝胚胎的Unigene共11,450条被注释,在生化过程、细胞组分和分子功能这三大模块中分布均衡,为后续的深入研究提供丰富的基因资源。3.BaP和DDT对翡翠贻贝胚胎的数字基因差异表达谱分析通过转录组学和数字基因表达谱测序技术(DGE)对无参考基因组的物种进行高通量测序,对质控合格后的翡翠贻贝胚胎差异表达基因进行DGE分析,筛选出BaP和DDT胁迫后显著富集的通路。结果表明:翡翠贻贝胚胎应答苯并芘胁迫的差异基因主要富集在免疫应激、传染病等通道;而应答滴滴涕胁迫的差异基因主要富集在与免疫应激、解毒代谢、氧化应激、神经退行性疾病等相关的通道。进一步选取显著表达的差异表达基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,结果表明实时荧光定量的 power 值与转录组基因的表达量 RPKM 值(the Reads Per Kilobase per Million mapped reads).的趋势一致,因此,结果表明转录组学数据具有真实可靠性,可为苯并芘和滴滴涕的分子胚胎毒理机理提供重要的科学数据。本研究构建的转录组数据平台不仅为翡翠贻贝提供了丰富的基因数据信息,同时为后续更多功能基因的挖掘以及翡翠贻贝胚胎应答典型POPs的分子胚胎毒理机理奠定了基础。
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