遗传多样性和物种多样性是生物多样性中最基本、最重要的两个层次。尽管有关植物种群遗传多样性和群落物种多样性的研究已经开展了大量的工作,但这些研究大多数是分别进行的,而有关植物种群遗传多样性和群落物种多样性关系的研究却相对比较缺乏。研究植物种群遗传多样性和群落物种多样性可能存在的关联方式,有助于理解决定植物种群和群落结构和动态的生态与进化过程,也有助于这两个层次生物多样性研究在基本理念上的整合。本研究对匍匐茎克隆植物蛇莓33个野生种群及其所在群落植被和环境条件(如种群面积)进行了调查,并采用SSR引物对其353个体的遗传多样性及遗传结构进行了分析。此外,通过相关分析,研究了蛇莓种群遗传多样性、群落物种多样性与环境条件之间的关系。研究发现,蛇莓野生种群的遗传多样性高,所有种群均为多克隆种群,且基因型的局域性很强,遗传差异主要表现在种群间,但在种群内也较高。这表明该物种种群间和种群内在一定程度上能通过有性繁殖进行基因交流。蛇莓种群建群者的奠基者效应和生境中环境/非环境因子对其遗传多样性和遗传结构的形成和进化具有重要的意义。研究还发现,种群遗传多样性、克隆多样性以及物种多样性都与样地面积及蛇莓的种群大小均呈显著的正相关；遗传多样性与克隆多样性之间存在显著的正相关；但是遗传多样性与物种多样性之间不存在显著的相关性。这表明,虽然蛇莓种群遗传多样性与群落物种多样性同时受种群面积等因素的共同驱动,但是还有其他因素对这两个水平的多样性具有更强的影响,使得蛇莓种群遗传多样性与群落物种多样性不存在相关关系。