本研究优化了SRAP-PCR反应条件，用SRAP标记技术构建了23个怀地黄品种的指纹图谱，研究了23个怀地黄品种间的遗传多样性及品种鉴定，为地黄品种的鉴定、种质资源保护、杂交育种的亲本选配和开发利用提供理论和技术依据。本论文的主要研究内容和结果如下： 1、建立了地黄的SRAP反应体系和扩增程序。PCR反应体系：反应总体积为25μL包括：1×buffer扩增缓冲液，2.0 mmol/LMg2+，0.36μmol/L引物，0.30 mmol/LdNTPs，20 ng模板DNA和2.5 UTaqDNA聚合酶；扩增程序为：94℃预变性3 min后，前5个循环为94℃变性1 min，35℃退火1 min，72℃延伸1 min，后35个循环将退火温度提高到50℃，其它条件不变，最后72℃延伸7 min。 2、用SRAP分子标记研究了怀地黄品种遗传多样性和亲缘关系。从288对引物组合中筛选出13对能够扩增出清晰而稳定条带的引物，用于扩增23个怀地黄品种基因组DNA，共扩增出338条谱带，其中多态性条带310条，平均多态性比率为91.71％，有效等位基因数为1.3229，杂合度为0.2008，Shannon多样性指数为0.3217，遗传相似系数在0.335-0.703之间，平均遗传相似系数为0.518。根据23个品种的Jaccard相似系数，进行聚类分析，绘制树状图，将23个品种划分为4个类群。三个北京系列和野生1号、9104、9302、串地龙、金状元、85-5、武陟1号、农家、小黑英聚为A类，野生2号独自聚为B类，武陟系列中除武陟1号外其余8个武陟品种和生津1号聚为C类，金皇后单独聚为D类。主成分分析结果支持这一聚类结果。聚类图可将本研究23个地黄品种分为两个类群，外部形态特征相近的品种基本聚在一起。 3.利用23个怀地黄品种的SRAP指纹图谱，获得特异的DNA片段标记，进行了品种分子鉴定。7对引物组合共鉴定出14个地黄品种。其中em3/me17引物组合鉴定出金皇后(700bp)、9302(170.bp)、农家(20.bp)、野生2号(160.bp)、武陟5号(520bp、220 bp)、武陟9号(140.bp)，em8/me18引物组合鉴定出北京1号(530 bp)、武陟3号(490 bp)、武陟5号(590 bp)、武陟6号(520 bp)、武陟7号(40.bp)，em12/me18引物组合鉴定9104(270 bp)、北京2号(60.bp)、野生2号(265 bp、420 bp、590 bp)、武陟5号(490 bp)。丰富了地黄品种鉴定的方法。 综上所述，SRAP标记技术用于怀地黄品种遗传多样性评价、亲缘关系分析和品种鉴定是可行的。