水稻糙米蛋白质含量QTL的定位与验证

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蛋白质含量是决定稻米营养和蒸煮食味品质的关键因素,解析稻米蛋白质含量的遗传机理对水稻品质改良具有重要意义。本研究用黄华占(Huanghuazhan,HHZ)/吉资1560(Jizi1560,JZ1560)重组自交系群体,结合分子遗传图谱和稻米蛋白质含量的两年数据,对控制稻米蛋白质含量的数量性状座位(Quantitative trait locus,QTL)进行初步定位,并对其中稳定遗传的qGPC1-1,构建剩余杂合体衍生的F2群体和多代回交的BC3F3群体进行遗传效应验证,主要结果如下:1.用近红外反射光谱(Near infrared reflectance spectroscopy,NIRS)分析技术和凯氏定氮(Kjeldahl nitrogen determination,KND)法测定280个重组自交系及亲本的糙米蛋白质含量。同一年份两种检测方法所获得的蛋白质含量显著相关,相关系数分别为0.966(2016)和0.983(2017),表明NIRS方法检测的糙米蛋白质含量和KND检测结果相近,均能较好地检测糙米的蛋白质含量;而不同年份同一检测方法所获得的蛋白质含量也显著相关,相关系数分别为0.638(NIRS)和0.631(KND),说明糙米蛋白含量主要受遗传控制,也容易受环境影响。重组自交系的蛋白质含量表现为连续分布,且有明显的超亲优势。应用包含18,194个SNP标记的高密度测序图谱,共检测到14个控制糙米蛋白质含量的QTL,分布在除第6、9和12外的其它9条染色体上,分别解释了0.81%-18.59%的表型变异,14个QTL中有7个在两年间被重复检测到。应用基于PCR扩增和凝胶电泳检测的包含208个SSR和InDel标记的低密度图谱,检测到14个QTL,但只有3个QTL在两年中被重复检测到。位于第1染色体短臂上的qGPC1-1在两年中被稳定检测到,解释了9.14%-11.85%的表型贡献率,增效等位基因来自JZ1560,且遗传效应较大,用于进一步的遗传效应验证和精细定位。2.对控制糙米蛋白质含量QTL qGPC1-1的遗传效应进行验证。从一个qGPC1-1目标区间基因型杂合的重组自交系中挑选3个F8剩余杂合体单株,自交后构建3个剩余杂合体衍生的F2群体,分别为WB01、WB02和WB03,这3个群体分别包含了180、137和115个单株。对目标区间标记加密后进行QTL分析,在WB01和WB02这两个群体中检测到qGPC1-1,与重组自交系群体的初定位结果相比,加性效应方向不变,表型贡献率提高,但在WB03群体中未检测到qGPC1-1,结合上述结果,qGPC1-1被界定于JD1006-JD1075区间约862 kb范围内。此外,以HHZ为轮回亲本构建验证qGPC1-1效应的3个BC3F3群体,分别为LW01、LW02和LW03,各包含了144个单株。结果显示除了LW03群体未检测到qGPC1-1,LW01和LW02这两个群体中都检测到qGPC1-1的效应,最终在不同的遗传背景下验证了qGPC1-1的遗传效应,并将目标区间缩小至JD1006-JD1071约597 kb范围内。本研究结果有助于阐明稻米蛋白质含量的遗传基础,并为分子标记辅助选择改良稻米品质提供依据。同时位于第1染色体短臂上控制糙米蛋白质含量QTL qGPC1-1的遗传效应验证,为下一步qGPC1-1的精细定位和克隆提供了基础。
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