论文部分内容阅读
信息学的发展，给生命科学带来新的机遇和挑战，产生了多学科交叉的生物信息学。从功能上，而非从细胞或有机体各个部分的特性上进行细胞的模拟和分析，是后基因组时代的研究热点。本文讨论生化代谢网络的分析和模拟。
本文首先介绍了生化代谢网络的概念、生化代谢网络分析的背景和意义，以及生化代谢网络分析方法的发展历史。在生化计量矩阵表示方法的基础上，论文系统介绍了生化计量矩阵分析的发展和基本理论，讨论了生化计量矩阵在生化代谢网络系统特性分析上的应用。
接着本文引入了凸锥分析和极限通路分析方法，在深入分析ExPA算法的基础上，做出了策略的优选、数据结构的改进和算法的并行处理，从而对算法的时间和空间消耗上都做出了改进。
最后论文开发了相应的计算和可视化平台，借助开发的平台，对算法的改进做出了验证，并将计算结果可视化。