2014年中国11省市猪流行性腹泻病毒ORF3基因分子流行病学调查

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猪流行性腹泻(porcineepidemicdiarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus,PEDV)引起的猪的一种急性、高度传染性的肠道疾病。该病毒主要破坏猪的消化道器官,其主要临床症状为急性肠炎、呕吐、水样腹泻和脱水。各年龄段以及不同品系的猪均对PEDV敏感,该病毒对哺育仔猪危害性非常大,其发病率为100%,死亡率为80~100%,给养猪业造成了严重的经济损失。2010年末PED在我国华南地区发生,随后在国内广泛流行,发病率和死亡率居高不下。为了研究猪流行性腹泻病毒在中国的流行情况,本课题组于2014年1月至12月对来自9个省份和2个直辖市(黑、吉、辽、内蒙古、冀、鲁、晋、苏、湘、京、津)42个发生腹泻猪场的165份腹泻样品,通过胶体金和RT-PCR等一系列实验方法对其进行了检测,结果显示,有25个猪场仅检测出了PEDV,占总数的59.52%;有11个猪场还检出了传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV),占总数的26.19%。165份被检测的病料中,病料总数44.24%的病料单独感染PEDV,数量为73份;有55份PEDV、TGEV、PoRV混感的病料,占总数的33.33%;其余样品的病原为其他肠道病病原。在42个发病猪场中,感染PEDV的猪场有36个,占猪场总数的85.71%;165份病料样品中,77.6%的病料样品呈PEDV阳性,数量为128份。本实验结果表明:PEDV在我国的猪腹泻病病原中占主导地位。根据获得的21株ORF3基因检测结果表明,均由675个核苷酸组成,与GenBank上已登录的12株国内外参考毒株进行序列比对,同源性为90.6%~100%。与国内外毒株同源性比较结果显示,中国目前流行毒株与欧洲毒株和中国较早流行毒株同源性较低,而与韩国毒株同源性较高。33个PEDV毒株的ORF3基因系统发育树显示,中国PEDV现地野毒株和PEDV参考毒株被分为2个群。
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