miR-126-3p与自噬相关基因对类风湿关节炎发病机制影响的研究

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研究背景:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种慢性全身性自身免疫性疾病,可累及全身关节。RA关节内主要表现为滑膜衬内层细胞增生、间质炎性细胞浸润、血管翳新生以及软骨和骨组织的破坏等。滑膜组织增生以成纤维样滑膜细胞(fibroblast-like synoviocytes,FLS)为主,是RA发病过程中的核心细胞。RAFLS的激活受多种机制影响,其中表观遗传和自噬是近年来的研究热点,它们在RA的发生发展中起重要作用。因此本研究以miR-126-3p及其下游表观遗传通路为研究对象进行相关分子机制探讨,并且还利用生物信息学分析筛选和验证RA中的自噬相关基因。目的:验证 RA FLS 中的 miR-126-3p/DNMT1/LBH 通路、研究 miR-126-3p 对 RAFLS分泌炎症介质能力、增殖能力和迁移能力的影响以及筛选验证在RA中的自噬相关基因。方法:1.验证miR-126-3p、DNMT1、LBH在RA FLS中的差异表达情况以及miR-126-3p对MH7A细胞和RAFLS中DNMT1和LBH表达水平的影响。利用慢病毒和脂质体构建miR-126-3p过表达和敲低模型,通过qPCR和western blot检测DNMT1、LBH表达水平。2.探索miR-126-3p对RAFLS炎症、增殖、迁移表型的影响,利用microRNA mimics和inhibitor进行miR-126-3p的过表达和敲低。qPCR和ELISA检测滑膜细胞中IL-6、IL-8的表达水平,western blot检测p-JNK水平,进行CCK-8实验和划痕实验。3.从Human Autophagy Database获取222个自噬相关基因,在GEO数据库获取类风湿滑膜组织基因表达谱芯片(GSE55235)表达矩阵,并对数据集进行分析后与自噬相关基因集取交集,以|logFC|>0.585 and adjust P-value<0.05为条件,筛选出差异表达的自噬相关基因集,后续进行PPI分析、GO分析、KEGG分析、相关性分析和qPCR验证。western blot检测miR-126-3p对RA FLS中LC3水平的影响,qPCR验证miR-126-3p对RAFLS中自噬相关基因水平的影响。结果:1.在RA FLS中过表达miR-126-3p可以下调DNMT1的mRNA水平。此外,在RA FLS中过表达miR-126-3p可上调LBH的mRNA水平。2.miR-126-3p可以抑制RA FLS分泌IL-8的能力。在MH7A细胞中,miR-126可以提高细胞增殖能力,上调p-JNK的蛋白水平。3.通过生信分析,我们筛选出52个RA的自噬相关基因。其中CASP8、TNFSF10、MYC、FOS、CDKN1A、EGFR和BNIP3是重要的自噬相关基因,可能成为RA潜在的生物标志物和治疗靶标。miR-126-3p在RA FLS中提高LC3-Ⅱ/Ⅰ的比值,下调CASP8和FOS的转录水平。结论:miR-126-3p是DNMT和LBH基因转录水平的上游调控分子。miR-126-3p在RA FLS中抑制IL-8的分泌能力,提高LC3-Ⅱ/Ⅰ的比值,下调CASP8和FOS的转录水平。miR-126在MH7A细胞中促进JNK通道激活并且提高细胞增殖能力。CASP8、TNFSF10、MYC、FOS、CDKN1A、EGFR和BNIP3 是RA中重要的自噬相关基因,这些结果可以扩大我们对RA发病机制的认识,并可能转化应用于临床。
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