本试验选用二倍体水稻93-11和同源四倍体水稻93-11作为基础材料,通过测定发芽期及其幼苗期的生理生化的指标,对两者在发芽期和幼苗期两个阶段的耐盐性进行研究,并结合转录组测序技术,分析二倍体、四倍体93-11水稻在NaCl胁迫下基因表达的差异,在分子水平上揭示二倍体、四倍体水稻的耐盐机理和应对NaCl胁迫时水稻基因表达上的差异,为更好的利用四倍体水稻种质、耐盐基因发掘和水稻抗逆新品种选育提供基础理论依据。以下为本试验的主要结论:1、NaCl胁迫对二倍体93-11和四倍体93-11种子萌发期耐盐性指标的影响规律基本一致,50-100mmol/L NaCl胁迫对两者发芽率、发芽势、株高、根长、根数等指标影响不大,而150-200mmol/L NaCl对两者均有较大影响,但在较高浓度NaCl胁迫下,四倍体93-11种子除发芽势受到的影响大于二倍体93-11外,其他各项指标受到的影响均小于二倍体93-11,表明四倍体93-11在萌发期的耐盐性要强于二倍体93-11。2、在水稻三叶一心期时,用150mmol/L NaCl进行胁迫,对不同胁迫时间下水稻幼苗的生理生化指标进行测定,结果表明相同浓度NaCl胁迫对二倍体、四倍体93-11幼苗的生理生化指标变化规律基本一致,但在胁迫周期内,四倍体93-11幼苗的脯氨酸、可溶性糖、叶绿素、SOD、POD指标明显高于二倍体93-11,丙二醛和电导率明显低于二倍体93-11,表明同源四倍体水稻93-11在受到胁迫后抗氧化能力更强,细胞损伤更少,积累渗透调节物质的能力强于二倍体93-11。3、在150mmol/L NaCl胁迫6小时的条件下对二倍体、四倍体三叶一心期的水稻幼苗进行转录组测序分析,测序结果表明,NaCl胁迫共引起二倍体93-11差异表达的基因数4930个,其中上调基因有3099,下调基因有1831个,四倍体93-11差异表达基因数为5850个,其中上调基因有3540,下调基因有2310个,经过GO和KEGG代谢通路的分析,发现两者与对照的差异表达的基因主要富集在植物激素信号传导通路上,并且对比发现四倍体93-11在玉米素、二萜类酸和α-亚麻酸等有关的植物激素合成和代谢途径中的上调蛋白酶多于二倍体93-11,通过对茉莉酸信号通路上有关基因的q PCR分析中发现,四倍体93-11在调控一些基因的表达变化量和响应时间上具有一定的优势,这表明染色体加倍使四倍体93-11在应对NaCl胁迫时具有更加复杂的响应机制,并且相比与二倍体水稻可能会具有更强的抗逆性。