浮游病毒作为海洋中丰度最高的生命体,在控制海洋生态系统中微生物群落结构的多样性、物质循环和能量流动方面起着不可忽视的作用。河口是淡水进入海洋的一个特殊的生态系统,是营养盐进入海洋生态系统的重要枢纽,受人类活动、淡水环境以及海洋环境的共同影响,是最为复杂的环境系统之一。然而目前对于河口地区的病毒生态过程和病毒的多样性的研究还相对甚少,本研究对中国典型河口地区病毒的生产力和降解率进行系统的调查,同时利用长江口冲淡水航次对长江口-东海海域T4类噬菌体的多样性进行研究,试图探究河口复杂环境中病毒的生态过程和多样性情况,主要结果如下:1.系统研究了长江口、钱塘江口、珠江口以及黄河口低盐淡咸水混合区和海水区的病毒丰度、生产力和降解率情况。研究结果显示病毒丰度变动范围在7.14±0.31 × 105-2.45 ±0.03 × 107 particles mL-1之间,病毒丰度与原核生物丰度呈明显正相关关系,受温度影响较大,并呈现出明显的季节性:夏季的病毒丰度明显高于冬季。病毒生产力在夏季的平均值为2.36 ± 1.73 ×106mL-1 h-1,冬季病毒生产力的平均值为1.15±0.86× 106mL-1 h-1,夏季病毒生产力会高于冬季(t-test,p<0.01)。不同河口因其营养状态和地理因素的原因导致病毒生产力存在较大差异,其中以长江口最高而珠江口最低。在钱塘江、珠江和黄河口,夏季低盐混合区的病毒生产力低于中盐海水区,而在冬季则低盐混合区更高,而在长江口的病毒生产力情况恰恰相反。夏季病毒降解率的平均值为1.26±0.75%h-1,冬季病毒降解率平均值为0.74±0.29%h-1,夏季病毒降解率明显高于冬季(t-test,p<0.05)。在夏季海水区因盐度高而明显高于混合区,在冬季却没有明显规律,说明不同的季节影响病毒生产力和降解率的因素有所不同。统计分析发现,病毒生产力与病毒丰度、原核生物丰度、pH具有显著的正相关关系,而降解率更可能是受多环境参数影响。2.以g23基因为标记基因,采用高通量测序的手段,对东海海域T4类噬菌体的多样性研究,结果表明在东海海域,T4类噬菌体存在着很高的多样性。在所研究区域表层的多样性高于相应站位的底层,所有站位均以某一两个OTU或类群占主导优势,底层的更明显。绝大多数OTU只出现在个别站位,而个别的OTU出现在所有的站位。系统发育分析发现东海海域以海洋类群为主要类群,其中Marine Group Ⅳ最多,几乎在所有站位为优势类群,Marine Group Ⅰ,Marine Group Ⅲ,Marine Group Ⅳ,Marine Group V,Exo T-evens 在所有站位均存在,Paddy Group类群只存在表层。东海T4类噬菌体受不同水团的影响较大,冲淡水带来了更多的淡水类群,Marine Group Ⅲ在冲淡水区域大量存在,而在其他区域却极少,推测该类群更适合淡水或低盐度的环境。