近年来湖泊的富营养化成为全球突出的环境问题，细菌对环境的变化反应最为迅速，其群落多样性与富营养化之间的关系尚在研究过程中，在水生生态系统中，细菌(尤其是异养细菌)可以分解水体中的大分子的有机物，并将其转化成细菌自身的生物能量或矿化成营养盐以供浮游植物进一步使用。因此，人们普遍认为，细菌在水生生态系统能量与物质流动中以及在营养循环中扮演着重要角色。对湖泊中细菌的结构、功能以及多样性的认识，有利于了解整个湖泊生态系统的特点，并可以评价水体的受污染程度。本文研究了乌梁素海富营养化最严重的红圪卜水域微生物群落结构及其丰度、系统发育多样性，以期充实和发展相关理论。　　 本文以乌梁素海富营养化湖区的可培养浮游细菌为研究对象，通过统计可培养浮游细菌的数量、采用纯培养法和基于16sDNA基因序列系统发育分析对乌梁素海富营养化湖区中细菌多样性进行研究，以期揭示可培养浮游细菌的丰度和多样性与乌梁素海富营养化之间的关系。　　 研究结果表明，乌梁素海水体中浮游细菌总数为1×105-6×106cru／L。本研究所得丰度指数不高，表明乌梁素海水体中虽然细菌数量较多，但多样性不高且物种均匀度低，其中的细菌可能集中于某些类属。用羧甲基纤维素钠(CMC-Na)，牛肉膏蛋白胨，光合细菌等培养基从乌梁素海富营养化湖区中分离到50株细菌菌株，根据形态观察和部分生理生化实验结果去冗余，选取41个有代表性的菌株进行基于16SrDNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明，这些菌株分属于γ亚群(Gammaproteobacteria，41％)，厚壁菌门(Firmicutes，32％)，变形菌门α亚群(Alphaproteobacteria，17％)，放线菌门(Actinobacteria，5％)，变形菌门β亚群(Betaproteobacteria，5％)5大类；27个分类单元，与数据库中已知的芽孢杆菌属(Bacillus)、微球菌属(Micrococcus)、杆状菌(Brevundimonas)、苯丙酮酸莫拉氏菌(Marinibacillus)、假单胞菌属(Pseudomonas)细菌、和动性球菌属(Planococcus)等具有很高的相似性，在营养丰富的地区γ-proteobacteria克隆占总克隆的比例要高一些，γ-proteobacteria中的某些类群成为优势菌群可能是对乌梁素海水体富营养化的响应。　　 本次分离得到一类较多的为Bacillus，该属有降解去除有毒、有机污染物的性能；分离得到的Novosphingobium是以菲为唯一碳源和能源可以降解多种多环芳烃的细菌，两者均可用于环境的治理；为今后开发和利用乌梁素海生物资源和修复乌梁素海生态环境提供了依据。