自主创新是指企业通过自身努力实现技术的突破，并在此基础上推动创新的后续环节，实现技术的商品化，获得利润，达到预期目标的一种创新活动。探讨增强企业自主创新能力是落实科学发展观的重大举措，也应该是我国、我国企业面向未来的重大战略选择与目标，具有深远的历史意义与现实意义，而一切有关提升企业自主创新能力的决策和措施，都应该以对企业进行自主创新能力评价为前提和基础。目前学者们对于自主创新的研究可以分为三个层次，即宏观国家创新体系层面、中观产业层面和微观企业层面。对企业自主创新能力的研究主要集中在创新能力、技术能力的发展路径研究；提高创新能力的内在机理和途径；创新能力不足原因及对策分析等方面。较少有通过自主创新能力评价对企业进行针对性分析，进而提出对企业进行创新能力提升的实证分析。本文从微观企业层面入手，在借鉴国内外相关研究成果基础上，以新经济增长理论、人力资本理论、知识经济理论等为理论基础，对企业自主创新能力建立评价指标体系并加以评价，通过分析企业创新基础能力、创新投入能力、知识获取学习能力、技术发明创造能力、创新效用产出能力等企业自主创新影响因素，以天华院为例，结合对该院的相关资料对其自主创新能力进行了评价，并提出企业自主创新持续发展的对策和建议。