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凡口铅锌矿床位于粤北曲仁构造盆地的北部活动边缘，区域旋涡构造与矿区弧形构造为对应的重要成矿构造。矿区辉绿岩属成矿前岩墙，是大规模构造—岩浆活动和成岩成矿作用的前锋。成矿作用主要发生在海西期末(二叠纪末)和燕山早期(侏罗纪)。从构造形变史与成矿期对比分析，铝锌元素在构造带中富集规律和构造热变质、构造退火作用、固态位移等方面研究表明：构造运动是成矿作用的主要动力。在实验室干体系高温高压成矿模拟实验中，成功地产生人工糜棱岩和微粒方铝矿；铅锌都在糜棱岩带集中，铅相对富集在糜棱岩带中央，锌富集在糜棱岩带边缘。