自中国共产党的十八届五中全会以来，绿色发展理念深入实践，绿色农业成为农业供给侧改革的重要发展方向。通辽市各旗县（市区）经过不断探索，在推动绿色农牧业发展方面取得了一定成绩，农业生产效率不断提高、农产品供给质量不断提升、农牧民人均收入不断增加。同时，通辽市绿色农牧业进一步发展也面临着一些制约因素。本文基于上述背景，对通辽市绿色农牧业发展过程中存在的问题进行探析，并结合相关理论，着重探讨县域政府在推动农牧业绿色发展中的职能。　　经过深入研究，通辽市绿色农牧业存在以下几方面问题:一是农村剩余劳动力规模依然较大，二是种植业集约化经营水平较低，三是畜牧业增产不增收问题严重，四是农牧业发展与生态保护的矛盾依然突出，五是县域农牧业主导产业趋同，特色产业滞后。针对通辽市绿色农牧业发展中存在的问题，在借鉴发达地区农牧业发展经验的基础上，提出县域政府在绿色农牧业发展中的具体职责:第一，多措并举转移农村剩余劳动力。一是着力发展县域工业，吸纳农村剩余劳动力;二是提升农村牧区教育水平，输出新生代劳动力;三是推动农业产业纵深发展，调整内部就业结构。第二，推动种植业向适度规模的集约化经营方向发展。一是探索新型土地承包方式和集体农庄制度，二是大力培育新型经营主体。第三，推动畜牧业向产业化方向发展。一是引导养殖户向专业化生产方向发展，二是全力打造“科尔沁”区域农产品公用品牌。第四，强力推行生态保护和环境治理工程。一是合理利用各类农业资源，二是建立县域农村垃圾处理体系，三是加强环境教育和宣传，鼓励公众参与，四是充分发挥环保科技的支撑作用。第五，主导和特色产业并重，加快绿色农业建设步伐。一是做大做强玉米产业，不断向纵深发展，二是变劣势为优势，推广高标准设施农业，三是培育具有区域优势的特色产业。