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本研究以甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系为研究对象,选取了15个微卫星位点(BM3413、BMS1724、BP33、MAF70、MCM38、OarHH35、BM3033、BMS648、OB2、MCMA26、BM1577、BM3501、BM6438、BM6506、BMS2145),利用微卫星标记技术首次对甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系的遗传多样性进行检测,统计了等位基因频率、等位基因型频率、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量等,并进行了微卫星标记与生产性状的相关性分析。选取的15个微卫星位点在甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系中共检测到113个等位基因,平均有效等位基因数为5.093,平均杂合度为0.783,平均多态信息含量为0.747,其中位点BM3413呈中度多态(0.25<PIC<0.5),其余位点均呈高度多态(PIC>0.5),表明该品系绵羊的遗传变异程度较高,遗传多样性丰富,基因一致性较差,可选择余地较大,这些微卫星位点可以用于甘肃高山细毛羊肉毛兼用品系遗传多样性和生产性状的相关性分析。利用SPSS11.5统计软件的一维方差分析(One-Way ANOVA)对15个微卫星位点与生产性状进行相关性分析,发现12个微卫星位点对部分生产性状有显著或极显著影响,位点BM6506对初生重影响极显著(P<0.01);OarHH35、BMS2145对断奶重影响极显著(P<0.01),OB2对断奶重影响显著(P<0.05);OB2对周岁体重影响显著(P<0.05);BM6506对日增重影响显著(P<0.05);BM6506对周岁腹毛长影响显著(P<0.05);BMS1724对周岁净毛率影响显著(P<0.05);MAF70、MCM38、OB2、BM6438对周岁纤维细度影响显著(P<0.05),BM3501、BM6506对周岁纤维细度影响极显著(P<0.01);BMS648对周岁纤维细度标准差影响极显著(P<0.01);BP33、BM1577对周岁纤维细度变异系数影响显著(P<0.05)。通过对与生产性状表型值显著相关的位点进行不同基因型间的多重比较,得到微卫星位点的有利基因型:OarHH35(断奶重137/117),BMS2145(断奶重152/152),BM6506(初生重182/182,周岁腹毛长234/202,周岁纤维细度228/188);BMS1724(周岁净毛率197/167),MCM38(周岁纤维细度148/128),OB2(周岁纤维细度244/204),BM6438(周岁纤维细度329/291),BMS648(周岁纤维细度标准差208/178),BM1577(周岁纤维细度变异系数184/176)。不利基因型:OarHH35(断奶重157/137),BMS2145(断奶重168/152),BM6506(周岁腹毛长196/196和182/182),MAF70(周岁纤维细度158/140),MCM38(周岁纤维细度158/138),BM6438(周岁纤维细度277/261),BMS648(周岁纤维细度标准差204/174),BP33(周岁纤维细度变异系数288/238),BM1577(周岁纤维细度变异系数176/166)。对部分生产性状有正面或负面影响的相关等位基因:OB2(断奶重/220/正效应,224/负效应;周岁体重/220/正效应,224/负效应),BM6506(初生重/182/正效应,228和188/负效应;日增重/196/正效应,188/负效应;周岁纤维细度/196/负效应),BM3501(周岁纤维细度/191/正效应),BM6438(周岁纤维细度/273和277/负效应),BMS648(周岁纤维细度标准差/178/正效应),BM1577(周岁纤维细度变异系数/166/负效应)。