农业综合开发作为财政支持农业产业化经营的重要手段和有效途径，从理论到实践已经过20多年的探索和发展，虽取得了显著成效，但该项财政支出的效率性与公平性究竟怎样，一直没有学者进行过深入研究。因此，如何在注重农业综合开发财政支出效率性的前提下，研究其公平性问题，具有重要的理论与现实意义。本文选取MBIA法研究农业综合开发产业化经营财政支出公平性，MBIA法是以实现资源配置效率性为基础研究资源配置公平性的方法。它是通过测度财政支出的边际归宿，即财政支出增加额的受益者及其受益情况，然后以基于效率的公平性财政支出结构为标准，评价财政支出边际归宿公平性的方法。本文论证说明如果富裕地区农民获得的加工业边际财政支出率高于贫困地区，而贫困地区农民获得的种植业和养殖业边际财政支出率高于富裕地区，那么，这样的财政支出结构能够实现基于效率的公平性。本文根据1997-2011年安徽农业综合开发产业化经营财政支出的经验数据，对其财政支出的边际归宿进行实证分析，研究结果显示：富裕地区农民在财政支持的三行业财政支出中获得的边际财政支出率都要高于中等地区和贫困地区，这表明安徽农业综合开发产业化经营财政支出具有明显的区域偏好性，其财政支出公平性不足。