在受托经济责任理论的指导下,高等学校内部审计工作二十年来取得了显著的成绩。然而,随着高校以国家财政拨款为主,多渠道筹集教育经费的格局形成,现有的审计制度、审计发展模式已经不能适应经济形势发展的需要,突出表现在内部审计机构独立性不强、审计结果不能有效运用、审计内容不能适应形势发展的需要等。解决高校内部审计存在问题的根本在于,在契约经济理论的指导下构建全新的内部审计运行模式,从体制机制方面改革不利于内部审计发展的诸多因素。优化高校内部审计的领导体制,建立高校校长领导下的审计委员会体制,并在审计委员会下成立独立的内部审计机构,以利于内部审计机构独立开展工作,发挥内部审计的作用。优化高校内部审计内容,由传统的财务收支审计向效益审计转变。优化高校内部审计方法,开展风险管理审计,提高审计效率,倡导和推动高校建立起有效的风险管理体系。优化高校内部审计质量控制,巩固内部审计的地位,减少审计风险,提高审计水平。